Constituée 13 membres (2 représentants par universités, un représentant de la linguistique, le directeur et le coordinateur), la commission scientifique est chargée de:
- fixer l’objet et le lieu des enseignements doctoraux;
- valider le programme;
- accepter un projet de budget annuel;
- établir un rapport annuel à la fin de chaque année civile;
- déterminer les conditions d’admission;
- assurer une politique de qualité;
- aider et statuer en cas de problème;
- veiller à l’équilibre intercantonal entre les institutions;
- établir un plan de développement pluriannuel.